Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1W4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1W4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1W4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C1W4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1W4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1W4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1W4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1W4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1W4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1W4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1W4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1W4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1W4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1W4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1W4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1W4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C1W4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1W4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1W4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1W4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1W4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1W4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1W4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1W4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1W4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1W4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1W4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1W4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1W4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1W4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1W4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1W4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1W4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C1W4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1W4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1W4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1W4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1W4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1W4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1W4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1W4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1W4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1W4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1W4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1W4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1W4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C1W4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1W4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1W4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1W4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1W4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1W4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1W4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1W4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1W4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1W4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C1W4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
H7C1W4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
H7C1W4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1W4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1W4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1W4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1W4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1W4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1W4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1W4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1W4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1W4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1W4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1W4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1W4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1W4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1W4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1W4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C1W4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C1W4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H7C1W4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H7C1W4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
H7C1W4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms