Protein–RNA interactions for Protein: F8W031

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W031 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
F8W031 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8W031 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8W031 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8W031 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8W031 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8W031 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
F8W031 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8W031 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
F8W031 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8W031 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8W031 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F8W031 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8W031 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8W031 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8W031 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8W031 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8W031 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8W031 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8W031 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8W031 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8W031 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8W031 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8W031 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8W031 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8W031 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8W031 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8W031 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8W031 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F8W031 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F8W031 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
F8W031 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
F8W031 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
F8W031 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F8W031 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F8W031 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F8W031 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
F8W031 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
F8W031 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F8W031 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
F8W031 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
F8W031 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
F8W031 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8W031 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8W031 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8W031 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8W031 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8W031 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8W031 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8W031 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
F8W031 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8W031 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8W031 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8W031 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8W031 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
F8W031 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8W031 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8W031 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8W031 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F8W031 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms