Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E9PBE3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
E9PBE3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E9PBE3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E9PBE3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E9PBE3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E9PBE3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
E9PBE3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
E9PBE3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E9PBE3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E9PBE3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E9PBE3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E9PBE3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E9PBE3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E9PBE3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E9PBE3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E9PBE3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E9PBE3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E9PBE3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E9PBE3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E9PBE3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E9PBE3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E9PBE3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E9PBE3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E9PBE3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E9PBE3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E9PBE3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E9PBE3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms