Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC160A6NGH7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC160A6NGH7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms