Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MAP1LC3B2A6NCE7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms