Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LYVE1Q9Y5Y7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LYVE1Q9Y5Y7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms