Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC1Q9Y5R8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms