Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GTF3C3Q9Y5Q9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms