Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRP12Q9Y561 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms