Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES2Q9Y543 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES2Q9Y543 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms