Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KLF12Q9Y4X4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLF12Q9Y4X4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms