Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NRXN3Q9Y4C0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN3Q9Y4C0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms