Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NFE2L3Q9Y4A8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NFE2L3Q9Y4A8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms