Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q9Y3F1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q9Y3F1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms