Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GIT1Q9Y2X7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIT1Q9Y2X7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIT1Q9Y2X7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIT1Q9Y2X7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIT1Q9Y2X7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIT1Q9Y2X7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIT1Q9Y2X7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIT1Q9Y2X7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIT1Q9Y2X7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIT1Q9Y2X7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GIT1Q9Y2X7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIT1Q9Y2X7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIT1Q9Y2X7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIT1Q9Y2X7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIT1Q9Y2X7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIT1Q9Y2X7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIT1Q9Y2X7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIT1Q9Y2X7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms