Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COG6Q9Y2V7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COG6Q9Y2V7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms