Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM2AQ9Y2K7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM2AQ9Y2K7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms