Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFSF13BQ9Y275 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNFSF13BQ9Y275 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms