Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC6Q9Y210 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms