Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TTC7AQ9ULT0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTC7AQ9ULT0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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