Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DENND2AQ9ULE3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DENND2AQ9ULE3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms