Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF3Q9ULD4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRPF3Q9ULD4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms