Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP21Q9UK80 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
USP21Q9UK80 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP21Q9UK80 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP21Q9UK80 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP21Q9UK80 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP21Q9UK80 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP21Q9UK80 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP21Q9UK80 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP21Q9UK80 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP21Q9UK80 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP21Q9UK80 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP21Q9UK80 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP21Q9UK80 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
USP21Q9UK80 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP21Q9UK80 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
USP21Q9UK80 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP21Q9UK80 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP21Q9UK80 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP21Q9UK80 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
USP21Q9UK80 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
USP21Q9UK80 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
USP21Q9UK80 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP21Q9UK80 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms