Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CPA4Q9UI42 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms