Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDX20Q9UHI6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms