Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHORDC1Q9UHD1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHORDC1Q9UHD1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms