Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
APOBEC3BQ9UH17 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
APOBEC3BQ9UH17 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms