Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TCF20Q9UGU0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms