Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NKX1-2Q9UD57 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NKX1-2Q9UD57 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms