Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CLN8Q9UBY8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms