Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DKK2Q9UBU2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK2Q9UBU2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms