Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MBD2Q9UBB5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms