Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL13Q9P2N7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL13Q9P2N7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms