Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDH10Q9P2E7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDH10Q9P2E7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms