Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHPF2Q9P2E5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHPF2Q9P2E5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms