Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP36Q9P275 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms