Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCHIP1Q9P0W5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCHIP1Q9P0W5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms