Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NLGN3Q9NZ94 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN3Q9NZ94 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms