Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PODXL2Q9NZ53 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms