Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GDAP2Q9NXN4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GDAP2Q9NXN4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms