Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRMT1Q9NXH9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRMT1Q9NXH9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms