Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERVK13-1Q9NX77 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK13-1Q9NX77 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK13-1Q9NX77 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK13-1Q9NX77 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK13-1Q9NX77 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK13-1Q9NX77 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK13-1Q9NX77 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK13-1Q9NX77 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERVK13-1Q9NX77 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms