Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
INTS9Q9NV88 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
INTS9Q9NV88 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms