Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DCAF13Q9NV06 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DCAF13Q9NV06 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms