Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPTLC3Q9NUV7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms