Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC35.6■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC35.57■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PDS5BQ9NTI5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms