Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SERINC1Q9NRX5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SERINC1Q9NRX5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms