Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAPOLBQ9NRJ5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms