Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SAR1AQ9NR31 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SAR1AQ9NR31 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms