Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
LHX9Q9NQ69 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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LHX9Q9NQ69 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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LHX9Q9NQ69 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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LHX9Q9NQ69 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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LHX9Q9NQ69 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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LHX9Q9NQ69 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LHX9Q9NQ69 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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